Parker dilahirkan di Herndon, Virginia. Ibunya, Diane Parker, seorang broker iklan TV, dan bapanya, Bruce Parker, ialah seorang ahli marin yang bekerja untuk pemerintah Amerika Syarikat.[4][5][9][10] Ketika Parker berusia 7 tahun, bapanya mengajarnya bagaimana membuat program di Atari 800.[4] Bapa Parker, yang mendahulukan keluarga di atas impian usahanya, mengatakan kepada Parker "jika engkau hendak mengambil risiko, lakukanlah sebelum berkeluarga."[11] Sewaktu remaja, hobicParker ialah menggodam dan membuat program komputer.[5] Pada satu malam, ketika sedang menggodam rangkaian suatu syarikat yang termasuk Fortune 500, Parker tidak mampu melog keluar setelah bapanya mencabut dan merampas kekunci komputernya.[5] Kerana alamat IP beliau sering terdedah, ejen FBI dapat menjejaki pemuda berusia 16 tahun itu.[5] Pada usia bawah 18 tahun, Parker dihukum dengan melakukan aktiviti kemasyarakatan.[5]